建立實驗室信息管理系統的目的是實現實驗室的信息化、科學化、規范化管理，確保檢驗信息的準確、充分利用，提高科室的管理效率。其應用已涵蓋科室業務工作及管理的各個方面。使工作人員擺脫現有工作模式下許多專業以外的負擔，最大限度地減少差錯的發生。將更多的精力放在質量控制、報告審核及解釋、科研分析等工作上，逐步實現從醫學檢驗到檢驗醫學的轉變。
檢驗科專業分工細，檢測項目多，但從工作流程看，都應包括檢驗申請、標本采集、標本核收、標本分析、結果報告、臨床反饋以及費用的確認等幾個環節。傳統檢驗科的工作模式只注重分析環節，檢驗質量難以提高，LIS的實施，就是要對每個環節進行科學化的管理，使每個環節準確、有序地進行，杜絕錯誤的發生。
Ø 生化、臨檢系統
生化、臨檢系統是LIS的主要組成部分。使用該系統可以使檢驗結果從檢驗儀器中直接傳入計算機,從而減少檢驗人員從儀器屏幕或儀器的打印報告中抄寫檢驗報告或登記的過程,對于手工結果錄入提供了缺省值與提示輸入法，這樣可大大減少了中文的輸入量，使手工的錄入也相當方便和快捷。對于錄入的檢驗結果可按多種條件在檢驗科室或病房直接查詢，從而也就提高了查詢速度，對臨床科室及時正確的得到檢驗數據提供了保證，同時也提高了檢驗科室的工作效率。
Ø 標本簽收登記（排單）
主要完成病人信息、檢驗申請及樣本信息登記，并完成工作單號編排，從HIS系統中直接查詢到具體病人的醫囑申請及繳費情況。
n 在檢驗中對每個標本，無論通過儀器測定或手工檢測，或打印等都需要在實驗科室排一個有序的編號，稱為工作單號。用于數據采集、報告打印、結果查詢等工作。工作單號當日同一臺儀器不能重復。
n 在資料輸入界面有病人列表功能：.在資料輸入窗口的列表中可直觀的看到當天病人的資料，并可以直觀的看到病人的數據結果是否審核或打印。
n 本系統與全院HIS聯網后，可通過門診（住院）號、磁卡調入HIS中的病人的基本信息。在化驗窗口添置一臺讀卡器，此讀卡器既可讀磁卡，也可讀IC卡，卡內存有病人的基本信息或可通過卡號從HIS中取到相關信息，可省去輸入的麻煩――這一步可由條形碼代替。
n 本系統與全院HIS接通后，可在申請登記時接收病區檢驗申請。包括檢驗項目、申請科室、標本種類等。并在檢驗安排后自動收費。對于門診病人沒收費的不顯示申請信息，從而杜絕漏費情況的發生。
n 對于有雙向通訊的儀器，檢驗科在收到標本后，離心后可直接上機操作，不需要再輸入病人信息等步驟，可以不用編號，或者需要再編號其目的也改變了（不再是為了與儀器上的數據進行對應而設）。
Ø 檢驗數據采集
通常自動化檢測儀都有RS232接口或其它通信方式，系統可以自動采集儀器上的數據，并實時寫到庫中。系統中如果聯接的儀器數量在兩臺以上，為了防止樣本號的沖突，每臺儀器都有本身的代號和分配的樣本號。
自動保存儀器的原始數據，以只讀的形式保存。原始數據的保存不再通過儀器自身所帶的打印機（內置或外置）打印，從而節約打印紙張，降低成本，同時也方便查詢。
Ø 條碼雙工
利用條形碼和儀器的雙向通信功能，能大大減少操作人員的工作量，系統全面支持條碼和雙工功能，優化醫院檢驗科的工作流程，詳見本章第6節。
Ø 結果輸入及修改
主要完成手工檢驗結果的錄入及已有結果的修改工作。
n 可以設置每一項目的缺省值，如“陰性”等。對于許多定性結果可定義輸入符號，如“+”為“陽性”，“-”為“陰性等”。也能定義組合項目，如輸入“JJ”（鏡檢的首拼），自動增加“鏡檢”的所有項目。這些方法使得個別不能聯機的儀器或手工檢驗的結果都能快速錄入到計算機。
n 對于高于正常值或低于正常值結果給予不同的標志(如顏色標識，可以自行設置不同的顏色含義)。超過項目生命極限或設定變化比例的則報警提示。
n 對于修改過的結果，可保留歷次修改前的結果、修改時間、修改人員等。也可輸入修改原因，便于審核人員查證。
n 整批樣本（結果）處理。對一批樣本號一次性輸入某個結果（這對于體檢項目，或某個項目在人群中帶有陰陽性傾向的項目特別有效）；在儀器發生偏差時，用于批量修改檢驗結果。如對一批結果的某一項目加上某一數值或乘以某一數值。并支持線性方程修改。如：結果=原結果*a+b等。此外，可對數據進行轉移、合并到其他樣本號。
n 特別的，系統設計了過濾“無法進行申請的項目”的功能也就是說因有個別的儀器無法進行聯機，通過手工登記項目結果，本功能可以在當日所有的申請單中快速過濾出你當前要輸入的單項，或者組合項目。
Ø 數據合并
在實際操作中，經常遇到對兩臺儀器做的數據進行合并的情況，系統設計了靈活的數據合并功能，并且可以在復做前進行篩選合并。
Ø 結果審核
本系統提供多種異常數據的報警，包括超出正常值、極限值、歷史結果、用戶自定義約束條件等，從而完全杜絕了差錯，真正成為檢驗醫生的好幫手。同時提供多種報告審核的手段，包括自動審核和手工審核，利用報告審核功能為用戶的報告發出嚴格把關，同時為檢驗科的質量管理提供系統化的支持，避免儀器操作不當或某些故障引起的錯誤。
一般在審核時進行收費的確認，如果計費失敗（如病人出院等原因），則審核不能通過，出現這種情況只有管理者或經管理者授權后才能順利審核。
可以根據需要設定是否只有通過審核才能打印、發布報告。
可自動列出該病人相同檢驗項目前五次的檢驗結果。
n 可由用戶預設審核條件，如與同一病人同一項目前次結果相比不能超過一定的比例或某一絕對值。
n 對于已由病區申請的檢驗，可比較申請項目與實際完成的項目，有差異時系統有自動提醒功能。可設置一張報告單的必須項目，以防止多做或漏做項目。
Ø 復做記錄查詢及審核
對復做記錄進行審核，對所有的復做標本都有記錄，以便查詢、審核。
Ø 標本狀態跟蹤
檢驗科對于標本所處的狀態進行跟蹤，分為以下幾類：
n 標本接收狀態：提示標本是否收到，由誰確認收到（核對者）等信息。
n 打印狀態：分成未審核未打印、已審核未打印及已審核已打印三個狀態。
n 完成狀態：即表示報告的最終狀態。
Ø 檢索、查詢
根據一定條件查詢某一范圍的檢驗結果。
n 可根據病人姓名、工作單號、檢驗儀器、日期范圍、送檢部門等查詢條件進行任意組合的查詢。對于姓名等條件可使用模糊查詢。系統能把輸入的任何漢字自動生成“拼音碼”即也有人稱之為首拼，在查詢時只要輸入姓名的拼音碼也同樣可以查出相應的病人，如張三只要輸入“ZS”。
n 可按檢驗項目查詢，比如，查詢ALT測定值大于某個值的情況。
n 支持模糊條件查詢。
n 數據可備份到光盤中，備份的數據可脫離LIS環境，只需把光盤放入電腦就可實現直接查詢、打印。
n 一般來說當前使用的庫的數據只保留一天，當天以外的數據放在歷史庫中，不影響查詢、統計等功能的使用。
n 對病人進行跟蹤，操作人中可對重點關注的病人作標記，這樣可以提示操作人員保留此標本以備復做等。